圣彼得堡和旅顺之间有着7个小时的时差，日驱逐舰向旅顺口俄舰发射鱼雷时，圣彼得堡时间是6月13日下午4点30分。当晚皇帝在夏宫内参加了一场舞会，11点时，阿列克塞耶夫发的紧急电报送到了夏宫。
尼古拉二世拿到电报时非常的震惊，他对着周边的侍从说道：“没有发布宣战公告，战争竟然就开始了！主啊，请拯救我们吧。”
可笑的是，阿列克塞耶夫只给皇帝本人发了电报，甚至都忘记了给陆军部和海军部发电。陆军大臣库罗帕特金在晚10时30分左右，于审计院主席罗普科将军处见到了财政大臣，从他那里得知了日军向旅顺口发动了袭击的事件，因为财政部驻旅顺专员给财政部发来了电报。
库罗帕特金赶紧前往了海军大臣阿韦兰处，但是两人等到了12点也没收到任何电报，这让两人一度以为旅顺口遭到袭击只是谣言了。不过很快，皇帝给他们发来了电报，表示自己正赶往彼得堡，要求明日召开关于日本袭击旅顺口的御前会议，两人才真正明白，日本确实攻击了旅顺口。
由于俄罗斯帝国并未设立内阁，所以御前会议实质上就等同于内阁会议了。作为俄罗斯全部权力的中心-沙皇，他可以决定让那些人参加决定国家大政方针的会议，也可以决定把那些人排斥在外，丝毫不用去理会这些人的原本职务，也就是说，俄国各大臣的权力并不来自于他们的职位，而是取决于他们距离沙皇的亲密距离。
这也是冒险家别佐勃拉佐夫能够引导俄国远东政策偏离了首相维特所制定的轨道的原因，因为他获得了沙皇的支持，所以就能推翻一切的定案。
此次的御前会议出席者也只有海军元帅阿列克谢大公和阿韦兰海军大臣、库罗帕特金陆军大臣、拉姆斯道夫外交大臣，侍从将军阿巴扎负责记录。会议上尼古拉二世脸色铁青，并不是因为旅顺口受到了攻击一事，而是觉得日本藐视了俄罗斯帝国，采取了不宣而战这种卑鄙的手段。
按照欧洲人的观点，文明人打猎的时候是不需要对猎物通报自己的行动的，但是和另一个文明国家开战的话，还是要以尊重的姿态宣布战争开始的。所以欧洲人向东方扩张时几乎不会发表宣战声明，他们只会公布一个主权声明，宣布这块土地被本国发现所有，非本国人员应当从这片土地上离开。
日本人的行动无疑是在鄙视俄罗斯帝国，把俄罗斯帝国当成了未开化的野蛮人，这对于尼古拉二世是难以忍受的，因为西欧各国也是这么看待俄罗斯的，这让尼古拉二世觉得，日本人拉低了俄罗斯帝国的地位，让俄罗斯帝国变成了一个笑话。
从这点来说，尼古拉二世就没法接受被日本人击败的后果。参与御前会议的都是尼古拉二世的近臣，他们都看出了尼古拉二世心中蕴藏的怒火，因此库罗帕特金首先呈交了西西伯利亚军区和喀山军区的五郡动员令，尼古拉二世很快就同意并签署了命令，这也让尼古拉二世的心情稍稍平静了些。
不过接下来对于远东战事的讨论，就没那么顺利了。西伯利亚大铁路虽然已经通车，1900年从欧洲调动一支部队抵达满洲至少需要77天，那么现在只要15天，可若是加上装备等一起转运，那么至少需要一个月的时间。
库罗帕特金向尼古拉二世这样介绍远东的形势，“在外贝加尔边区、阿穆尔边区和滨海边疆区，我们大约有6万5千人的兵力。
在满洲地区我们大概有接近29万人的兵力，其中长春以北的北满地区驻扎了约7万人，哈尔滨一地就驻扎了3万人；沿鸭绿江地区布置了约2师3万人，海城、辽阳、沈阳地区驻扎了3万人，关东州驻扎了3万人，锦州、朝阳以西的兵力使用已经达到了7个师10万人…”
库罗帕特金略过了对北京进攻的7个师实际有1个半师已经在伤亡名单上，还有一个半师现在正等着他们去救援，他只是着重强调道，“日军有15个常备师团，兵力超过20万。
也就是说，日本仅仅依赖常备师团的力量就对我南满陆军形成了压制，因为我们有7个师还在和中国人交战，并不能用于和日本交战。所以我们必须加强南满的力量，以防备中日在南满形成合击势态…
当然，最好的办法是尽快和中国方面停战，然后专心对付日本。”
外交大臣和海军大臣都赞成库罗帕特金和中国停战的提议，毕竟中国对于俄罗斯来说只是猎物，今天不打，明天也可以打，而日本则是俄国在远东的真正对手，一旦让日本在战争中占据了优势，那么俄国不仅将会失去朝鲜半岛和满洲，甚至连滨海边疆区、阿穆尔边区等地都保不住。
尼古拉二世也接受了这些大臣们的意见，不过他们对于中国的让步不过是各自罢兵，战后考虑把长春以南地区交还给中国，但必须要保证俄国对南支线铁路及关东州的地位。也就是说，彼得堡试图把和平恩赐给中国，并不承认自己在中国的入侵遭到了失败。
6月14日的御前会议上，尼古拉二世批准了外交部拟定的宣战诏书。就在这天，《官报》在头版头条隆重刊载了宣战诏书，不过这份诏书虽然指出了日本方面的背信弃义，但并不能让俄国的右翼分子感到满意，因为缺乏一种愤怒的情绪。
这次会议上，库罗帕特金被正式任命为远东陆军司令官。也在同一天，日本报纸上终于刊登出了《对俄绝交通告》，把三天的事情告诉了国民，还报道将在一两日内发布戒严令，大本营已经完成准备工作，并登载了昨日小村会见记者时发布的《日俄交涉始末》全文。
《东京朝日新闻》当日的社论是《举国一致的赫怒》，为日军偷袭旅顺口进行辩解；《韩国中立无效》这篇文章则以强盗逻辑说明了日军进入朝鲜的必然性；《旅顺海战大捷》的号外则激发了民众对于胜利的期待，东京各个社会团体以50人、100人地组团去海军省、外务省表示祝贺。
山本海相终于出了一回风头，对着来祝贺的群众满面春风的进行了致辞。银座的商店点亮了装饰彩灯，街上一派喜庆的气氛。傍晚，庆应义塾的两千多名学生举行了火炬游行。
这天傍晚，日本政府终于发布了宣战诏敕，以号外的方式在全东京散发。诏敕中使用了三次“保全韩国”“安全”这样的词语，再加上“韩国之存亡”，共使用了四次，强调日本是为了韩国、为了保全韩国而与俄罗斯发生战争的。
因为直到最后一刻，中国政府也没有向日本政府发出参战请求，日本政府无法以保全满洲的借口介入这场战争，便只能以保全韩国和维护东亚秩序为名义向俄国宣战了。
不过，日本将这份诏敕翻译成英语，送交各国政府，包括清政府，可唯独没有给韩国政府一份，因为日本方面认为没有必要向韩国出示宣战公告，因而没有送交。于是日本宣称要保全的对象韩国，居然要从俄国人口中得知日本和俄国开战的缘由。
也就在14日这一天，俄太平洋舰队司令官斯达尔克决定放弃秦皇岛登陆战，全舰队撤回旅顺口。6月10日下午俄军分舰队抵达秦皇岛外海，斯达尔克就派人给岸上的中国军队送信，要求对方放弃抵抗投降，这当然遭到了秦皇岛驻军的反对。
6月11日，斯达尔克派出辅助军舰进行扫雷，由于俄军并没有专业的扫雷艇，所以想要清理出一条通往秦皇岛的安全航道是非常缓慢的，直到6月12日傍晚，俄军也没能清理完成航道，不过俄军军舰对岸上的目标进行了威慑性炮击，以阻止中国军队对扫雷行动进行干预。
6月13日凌晨，斯达尔克接到了旅顺口遭到袭击的电报，他当即回电询问是否放弃登陆作战，自己这支分舰队下一步该如何行动。一开始阿列克谢耶夫并没有立即同意放弃作战，他试图先行击败中国军队的抵抗，迫使中国人和俄军议和，然后再全力对付日本人。
不过斯达尔克反复论证，试图告诉总督大人这不过是一种妄想，因为他们到现在都没能完全清理出通往秦皇岛港口的安全航道，再继续拖延下去，一旦日本舰队扑向秦皇岛，那么这支舰队和登陆部队就都危险了。
直到13日下午，阿列克谢耶夫才放弃了继续登陆秦皇岛的计划，他同意运兵船开向营口，让军队从营口登陆。但是对于斯达尔克所率领的分舰队，他一开始并不同意对方直接返回旅顺口，因为他担心日本舰队会在渤海和黄海的交接处伏击分舰队。
但是斯达尔克再一次向阿列克谢耶夫说明，这支舰队没法在营口获得保护和物资资源，因为营口不是一个军港，而他们只要突破老铁山水道，就进入到了海岸炮垒的保护之下，因此完全可以在旅顺口外海和日舰队周旋，相机返回港内。
斯达尔克最后还指出，哪怕日舰队完全封锁了前往旅顺口的航道，他们进入黄海后也有极大的回旋空间，不管是北上袭击日本本土，再前往海参崴军港，或者南下在上海进行补给，都比关在渤海强。阿列克谢耶夫最终还是接受了斯达尔克的主张，于是就有了6月14日晚，俄分舰队通过老铁山水道的冒险之举。